缓慢启动后在美国跟踪病毒变种有所改善

在起步缓慢后，美国改进了其监测系统，以追踪 Omicron 等新型冠状病毒变种，自今年年初以来每周处理数万个样本，从而提高了能力。

病毒是不断进化的。 为了发现和追踪新版本的冠状病毒，科学家们分析了部分检测呈阳性的样本的基因组成。

他们搜索病毒遗传密码的化学字母，以寻找令人担忧的新变种，例如 omicron，并跟踪已知变种（例如 delta）的传播。

这是一项全球性的努力，但直到最近，美国的贡献很少。 测试不协调、零散，美国一直在排序列 今年早些时候，只有不到 1% 的阳性样本。 现在，这些测试是对 5% 到 10% 的样本进行的。 这更符合其他国家和地区的顺序 与全球疾病追​​踪器共享 整个疫情期间。

“基因组监测是强大的，”公共卫生实验室协会传染病主任凯利·沃罗布洛斯基说。

为这项工作做出贡献的是大约 70 个州和地方公共卫生实验室，它们每周安排 15,000 到 20,000 个样本。 其他实验室，包括由疾病控制和预防中心及其承包商运营的实验室，每周总数达到 40,000 至 80,000。

九个月前，每周大约有 12,000 个样本以这种方式进行分析。

明尼苏达大学的肯尼·贝克曼 (Kenny Beckman) 说：“与一年前甚至六九个月前相比，我们处于一个更好的境地，”他称赞将联邦资金分配给公共和私人实验室。 他经营着大学的基因组学实验室，该实验室现在每周从明尼苏达州、阿肯色州和南达科他州等州安排大约 1,000 个样本。 一年前，实验室没有进行测序。

美国利用总统乔·拜登 (Joe Biden) 总统的冠状病毒救助法案中的 17 亿美元，正在努力建立一个全国网络，以更好地跟踪冠状病毒高峰。

然而，约翰霍普金斯大学彭博公共卫生学院的威廉莫斯博士表示，大约有二十几个国家的阳性样本比例高于美国。 Omicron 的出现可以“激励美国做得更好”。

“我认为我们还有很长的路要走，”莫斯说。

一些国家 被序列化 位于圣地亚哥的开发基因测序技术的公司 Illumina 的首席医疗官 Phil Vibo 博士指出，只有大约 1% 的样本，而其他人则在 20% 的范围内。

Fibo 说：“我们可以在这方面更加系统和更加一致，因此我们确保没有基因监测的沙漠，我们可能会错过变种的出现。”

在监测工作的帮助下，使用发送到实验室的鼻拭子进行的标准 PCR 测试可以检测到某人可能患有 omicron 变体的迹象。 如果三个目标基因中只有两个的 PCR 测试呈阳性——即所谓的 S 泄漏测试结果——即使在基因测序的额外步骤来证明它之前，这也是 omicron 的标志。

这很幸运，”弗雷德哈钦森癌症研究中心的生物学家和遗传学家特雷弗贝德福德说。 “如果需要序列化变量选择，总是会晚一点，成本会更高。如果仅仅依靠这个S-dropout作为选择，会更容易一些。”

他说其他变量也在 PCR 测试结果中引起了这种偏差，但不是 delta 变量。 贝德福德说，由于达美航空目前在美国占据主导地位，因此将会注意到 S-dropout。 （贝德福德从霍华德休斯医学研究所获得资金，该研究所也支持美联社的健康与科学部。）

美国顶级传染病专家安东尼·福奇博士表示，奥美光“不可能”进入美国。

几位专家表示，他很可能已经到了，很快就会被监控系统接走。 但问题是接下来怎么办？

“我们没有那种可以在任何地方控制病毒的州际旅行限制，”威斯康星大学艾滋病研究员大卫奥康纳指出。

他说，相反，基因监测将告诉官员 omicron 是否在一个地方以异常的速度传播，以及是否应该向这些地方发送更多资源。

当 Omicron 出现时，公共卫生当局将不得不在分流工作中考虑其他变量，例如该社区中已经存在的感染水平和疫苗接种率。 在高度设防的地区爆发这种危险的疾病将特别令人担忧。

然而，明尼苏达大学的贝克曼认为显着压缩序列没有什么好处。

“我不需要对超过百分之几的阳性病例进行排序就可以了解它们的增长速度，”他说。

与其他一些国家不同，如果人们对令人担忧的变异检测呈阳性，美国政府官员没有行使强制隔离的权力。 鉴于此，测序主要是用于跟踪突变传播的监测工具。

“我认为跟踪变量很重要，但我认为认为我们能够快速并在足够大的范围内进行测序以阻止变量在其轨道上运行是不切实际的，”贝克曼说。

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美联社作家 Laurent Niergaard、Matthew Perrone 和 Ricardo Alonso Zaldivar 做出了贡献。

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美联社健康与科学部得到霍华德休斯医学研究所科学教育部的支持。 AP 全权负责所有内容。